Группа китайских исследователей, состоящая из Шэньчжэньской второй народной больницы, BGI и других институтов, сообщает о своем последнем исследовании геномики рака мочевого пузыря, которое было опубликовано в Интернете в журнале Nature Genetics. Открытия были сделаны с использованием технологий полногеномного и экзомного секвенирования и предоставили доказательства того, что генетические изменения, влияющие на процесс когезии и сегрегации сестринских хроматид (SCCS), могут быть вовлечены в онкогенез мочевого пузыря и открывают новый способ лечения рака мочевого пузыря.
Переходно-клеточная карцинома (TCC) – это наиболее распространенный тип диагностированного рака мочевого пузыря, на который приходится 90% всех злокачественных новообразований мочевого пузыря в Северной Америке, Южной Америке, Европе и Азии. Сообщается, что только в 2008 году было зарегистрировано 386 300 новых случаев рака мочевого пузыря и 150 200 смертей. А в 2010 году число погибших достигло 170 тысяч. До сих пор не было доступных полных геномных данных для разработки новых терапевтических подходов к борьбе с раком мочевого пузыря.
Для более глубокого понимания генетической основы, лежащей в основе TCC, китайские ученые провели секвенирование экзома опухоли и сопоставили образцы периферической крови 99 пациентов с TCC и выявили 1023 соматических замены и 67 инделей соответственно. Они выполнили полногеномное секвенирование (WGS) для обнаружения изменений числа копий (CNA) и получили 4-кратное среднее гаплоидное покрытие для каждого образца.
После оценки генетических изменений или вариантов исследователи обнаружили частые изменения в двух генах, STAG2 и ESPL1, которые связаны с процессом когезии и сегрегации сестринских хроматид (SCCS). Среди них STAG2 был особенно примечателен тем, что укрывал большее количество несинонимичных мутаций и более высокое соотношение несинонимичных мутаций к синонимичным. Их исследование показало, что хромосомная нестабильность и анеуплоидия оказали влияние на рак мочевого пузыря, и предоставило доказательства того, что рак мочевого пузыря стал первым типом рака с серьезными генетическими нарушениями в генах SCCS.
Кроме того, исследователи обнаружили рецидивирующее слияние двух других SCCS-связанных генов, FGFR3 и TACC3, путем секвенирования транскриптома 42 ДНК-секвенированных опухолей. Они предположили, что FGFR3 / TACC3 связан с онкогенезом мочевого пузыря, а высокая экспрессия TACC3 опосредована транскрипционными регуляторными элементами в промоторе партнера по слиянию, FGFR3, а не амплификацией TACC3.
Чао Чен, старший научный сотрудник BGI, сказал:, "Это большой прогресс в генетических исследованиях рака мочевого пузыря. Мы обнаружили частые изменения в STAG2 / ESPL1 и рецидивирующем слиянии FGFR3-TACC3, что свидетельствует о том, что генетические изменения, влияющие на процесс SCCS, могут участвовать в онкогенезе мочевого пузыря и предполагают новый терапевтический подход к лечению рака мочевого пузыря. Кроме того, геномные данные, полученные в этом исследовании, также закладывают прочную основу для наших дальнейших исследований рака мочевого пузыря."