Исследователи разрабатывают новый подход к визуализации и измерению белковых комплексов в опухолях

Принятие решения о диагностике рака и лечении часто затруднено из-за отсутствия знаний о биологических процессах, происходящих в опухоли. Исследователи из онкологического центра Моффитта разработали новый подход к анализу этих процессов с помощью метода, называемого методом лигирования методом близости (PLA). PLA позволяет визуализировать и измерять специфические белковые комплексы в образцах рака. Это может помочь в принятии решения о лечении пациента в будущем.

Клинические исследователи и врачи часто полагаются на измерения биомаркеров рака в качестве диагностических, прогностических или лечебных индикаторов. Биомаркеры рака – это биологические характеристики опухолей, такие как генетические мутации, уровни экспрессии белка или события модификации белка. Текущий анализ биомаркеров в первую очередь сосредоточен на отдельных генах или белках. Однако белки не функционируют сами по себе; скорее, они часто являются частью более крупных мультибелковых комплексов и могут взаимодействовать со многими различными белками. Используя только отдельные белки в качестве биомаркеров, клиницисты могут не иметь точного описания того, что на самом деле происходит в опухоли.

Исследователи Моффитта разработали подход PLA к образцам рака для анализа белковых комплексов и обеспечения лучшего понимания событий, которые происходят при раке. Они сосредоточили свое исследование на рецепторе эпидермального фактора роста (EGFR), который часто мутирует или экспрессируется на высоком уровне во многих типах опухолей, включая немелкоклеточный рак легкого, плоскоклеточный рак головы и шеи и почечно-клеточный рак. Они обнаружили, что пациенты с раком легких, которые лечились ингибиторами EGFR и имели большое количество белковых комплексов EGFR, имели лучший прогноз.

Эти белковые комплексы могут стать новыми биомаркерами, которые помогут врачам диагностировать и лечить пациентов с помощью определенного класса препаратов, называемых ингибиторами рецепторной тирозинкиназы. Анализ протеинового комплекса с помощью PLA также может помочь врачам определить, как пациенты становятся устойчивыми к этим препаратам.

Эта работа была первым шагом в оценке терапевтических белковых комплексов в образцах рака. "Мы показываем, что возможно создать анализы, отражающие белковые комплексы в раковых клетках, и эти анализы связаны с чувствительностью к лекарствам. Наша лаборатория разрабатывает дополнительные анализы, отражающие белковые комплексы, имеющие отношение к лечению рака, и мы предполагаем, что сможем использовать эти анализы, чтобы помочь нашим пациентам принимать терапевтические решения," сказал Эрик Б. Хаура, М.D., директор Центра передового опыта по лечению рака легких в Моффитте.

"Мы думаем, что это захватывающий новый способ взглянуть на целевую сигнальную активность в раковых клетках. Если мы сможем выяснить, какие молекулярные пути активированы, мы сможем лучше сопоставить пациентов с доступными целевыми методами лечения и, будем надеяться, улучшим результаты," сказал Мэтью Смит, доктор философии.D., MSPH, постдокторант в Моффитте.

Это исследование было опубликовано в январе. 13 выпуск Science Signaling, который будет обсуждаться в подкасте на сайте Science Signaling.