Согласно отчету, опубликованному на этой неделе в журнале Cell Reports Medicine, новое исследование проливает свет на истоки вспышки болезни, вызванной вирусом Бундибугио в 2012 году в Демократической Республике Конго. Работа также демонстрирует важность использования высокопроизводительного секвенирования для понимания вирусов "перетекание" мероприятия для более эффективного управления вспышками заболеваний.
В исследовании международная команда под руководством U.S. Армейский научно-исследовательский медицинский институт инфекционных заболеваний демонстрирует, как высокопроизводительное секвенирование – одно из основных направлений деятельности USAMRIID – может быть ретроспективно использовано для определения источников вспышки заболевания и предоставления ключевой информации о появляющихся патогенах, имеющих важное значение для военного и общественного здравоохранения.
Вирус Bundibugyo – один из четырех вирусов эболавируса, вызывающих болезни человека, и на африканском континенте произошло несколько вспышек. Для него характерны гриппоподобные симптомы, которые иногда сопровождаются диареей, рвотой, болью в груди и кровотечением. Выжившие могут страдать от боли в суставах, нечеткости зрения и потери слуха.
Как и в случае с другими эболавирусами, "резервуар" Bundibugyo – что означает основной хозяин, который является носителем вируса – остается неизвестным, по словам авторов. Таким образом, экология вируса и механизм его передачи в человеческую популяцию изучены недостаточно.
В результате вспышки 2012 года было зарегистрировано 38 лабораторно подтвержденных случаев заражения людей, 13 из которых умерли. Однако, по словам MAJ Jeffrey R. Кугельман, к.D., один из ведущих авторов исследования.
Анализ последовательностей, проведенных USAMRIID у 7 дополнительных пациентов, показывает, что несколько вирусов "перетекание" события способствовали вспышке – ни одного события, как описано ранее, – и что одно из вторичных событий, вероятно, произошло на несколько недель раньше, чем предполагалось ранее.
"Анализ молекулярной эпидемиологии и эволюционной динамики вспышки 2012 г. с использованием этих дополнительных изолятов ставит под сомнение текущую гипотезу о том, что вспышка явилась результатом единственного вторичного события," сказала MAJ Christine Hulseberg, Ph.D., первый автор статьи. "Кроме того, филогенетический анализ предполагает, что первоначальное появление вируса произошло на 50 дней раньше, чем считалось ранее."
Секвенирование вирусного генома не только играет ключевую роль в выявлении цепочек передачи по мере развития вспышки, но и помогает ученым лучше понять общие закономерности распространения и дает информацию для усилий общественного здравоохранения по борьбе со вспышками в будущем. Это также позволяет исследовать генетические мутации, которые могут повлиять на способность вируса выживать и вызывать заболевание.
Это исследование было проведено в USAMRIID в рамках продолжающихся усилий по борьбе с вирусом Эбола и эпиднадзору в рамках проекта, "Оценка клинических образцов вирусных геморрагических лихорадок известной и неизвестной этиологии у человека." Это также одно из первых запланированных совместных проектов с Медицинской школой Икана на горе Синай, Нью-Йорк, закладывающее основу для будущих совместных исследовательских инициатив по защите национального и глобального общественного здравоохранения. Партнерство USAMRIID с ISMMS направлено на максимальное повышение эффективности инвестиций Министерства обороны в исследования, разработки, тестирование и оценку путем обеспечения интеграции и сотрудничества с исследовательскими центрами биомедицинских инфекционных заболеваний с аналогичными целями.