В новом анализе исследователи пролили свет на эти наследственные элементы через 12 типов рака – показ, что удивление унаследовало компонент к обеспечению и раку желудка некоей нужной ясности в последствиях определенных типов мутаций в известных генах чувствительности рака молочной железы, BRCA1 и BRCA2.Изучение, из Вашингтонской Университетской Медицинской школы в Сент-Луисе, появляется 22 декабря в издании Nature Communications.Следователи проанализировали генетическую данные больше чем от 4 000 случаев рака, включенных в проект Атласа Генома Рака, инициатива, финансируемая Национальными Университетами Здоровья (NIH), дабы распутать генетическое основание рака.
«В целом мы знали, что яичниковый и рак молочной железы имеют большой унаследованный компонент, и у других, таких как острая рак и миелоидная лейкемия легких, имеется значительно меньший унаследованный генетический вклад», сообщил ведущий создатель Ли Динг, врач философии, адъюнкт-помощник директора и профессор медицины Университета Генома Макдоннелла в Вашингтонском Университете. «Но это – первый раз в большом масштабе, что мы были в состоянии определить генных преступников либо кроме того фактические мутации, важные за чувствительность рака».Новая информация имеет последствия для улучшения точности существующих генетических тестов на риск рака и в конечном итоге расширения дешёвых тестов, дабы включать более широкое множество опухолей.Прошлые геномные изучения рака сравнили упорядочивание данных из опухолей и здоровой ткани пациентов тех же самых больных. Эти изучения раскрыли мутации, существующие в опухолях, помогающие исследователи определяют ответственные гены, каковые, возможно, играют роли в раке.
Но данный тип анализа не имеет возможности различать унаследованный презент мутаций при мутации и рождении, купленные по длительности судьбы.Дабы оказать помощь чесать унаследованные компоненты рака, новое изучение додаёт анализ упорядочивающих данных из обычных камер больных, каковые содержат данные «о зародышевой линии».
Зародышевая линия больного – генетическая информация, унаследованная от обоих своих родителей. Данный новый слой информации дает генетическое основание генов больного при рождении и может продемонстрировать, находились ли мутации, которые связаны с раком уже.В любых ситуациях рака они проанализировали, следователи искали редкие мутации зародышевой линии в генах, каковые, как мы знаем, были связаны с раком.
В случае если одна копия одного из этих генов от одного родителя уже видоизменена при рождении, вторая обычная копия от другого родителя довольно часто может давать компенсацию за недостаток. Но люди с этими мутациями более чувствительны к так именуемому «второму хиту».
Потому, что они стареют, они в более высоком риске развивающихся мутаций в остающейся обычной копии гена.«Мы искали мутации зародышевой линии в опухоли», сообщил Динг. «Но это было не хватает для мутаций легко, дабы находиться; они должны были быть обогащены в опухоли – воображают на более высокой частоте.
В случае если мутация присутствует в зародышевой линии и усиленный в опухоли, имеется высокая возможность, это играет роль в раке».В 114 генах, каковые, как мы знаем, были связаны с раком, они нашли редкие мутации зародышевой линии во всех 12 типах рака, но в переменных частотах в зависимости от типа.
Они сосредоточились на типе мутации, названной усечением, по причине того, что большая часть усеченных генов не имеет возможности функционировать по большому счету.Из случаев рака яичника обучались следователи, 19 процентов из них несли редкие усечения зародышевой линии. Наоборот, лишь 4 процента острых миелоидных случаев лейкемии в анализе несли эти усечения в зародышевой линии.
Они кроме этого нашли, что 11 процентов случаев рака желудка включали такие усечения зародышевой линии, что был удивлением, по словам исследователей, по причине того, что то число на одном уровне с процентом для рака молочной железы.«Мы кроме этого нашли большое количество усечений зародышевой линии в BRCA1 и генах BRCA2 существующим в типах опухоли не считая рака молочной железы, включая случаи и живот рака простаты, к примеру», сообщил Динг. «Это предлагает, дабы мы обратили внимание на потенциальное участие этих двух генов в других типах рака».BRCA1 и гены BRCA2 ответственны для ремонта ДНК. Тогда как они, в первую очередь, связаны с риском рака молочной железы, данный анализ поддерживает растущий корпус данных, что они оказывают более широкое влияние.
«Больных с усечениями BRCA1 в зародышевой линии 90 процентам обогатили это усечение BRCA1 в опухоли, независимо от типа рака», сообщил Динг.Генетическое тестирование BRCA1 и генов BRCA2 в дамах из-за угрозы рака молочной железы может продемонстрировать очень нужную данные для предотвращения. В то время, когда, к примеру, гены, как показывают, обычны, нет никакого повышенного генетического риска рака молочной железы. Но в случае если любой из этих генов видоизменен методами, каковые, как мы знаем, отключают любой ген, риск рака молочной железы значительно увеличен.
В данной ситуации генетические консультанты и врачи смогут оказать помощь дамам совершить варианты, доступные для того, чтобы снизить тот риск.Но мутации существуют многих вариантов.
Генетическое тестирование кроме этого может продемонстрировать многих, у которых имеется малоизвестные последствия для функции этих генов, так, их влияние на риск рака не может быть предсказано.Дабы оказать помощь разъяснить эту серую область в клинической практике, Динге и ее сотрудниках Джеффри Парвине, MD, враче философии, учитель и директоре по разделению вычислительной биологии и биоинформатики в Университете штата Огайо и Фэн Чэня, врач философии, адъюнкт-доктор медицинских наук в Вашингтонском Университете, изучил 68 мутаций неусечения зародышевой линии малоизвестного значения в гене BRCA1.
Для каждой мутации они удостоверились в надежности, как прекрасно белок BRCA1 имел возможность выполнить одну из собственных главных функций ремонта ДНК. Исследователи нашли, что шесть из мутаций вели себя как усечения, отключая ген всецело. Эти мутации кроме этого были обогащены в опухолях, поддержав возможную роль в раке.
«Принципиально важно быть в состоянии продемонстрировать, что эти шесть мутаций малоизвестного клинического значения – в действительности, мутации утраты функции», сообщил Динг. «Но я кроме этого отмечу контрастирующую идея. Еще многие показывают обычную функцию, по крайней мере в соответствии с отечественному анализу. Многие из этих типов мутаций нейтральны, и мы желали бы выяснить их так, дабы медицинские работники имели возможность лучше порекомендовать своим больным».Динг заявил, что больше изучения нужно, дабы подтвердить эти результаты, перед тем как они смогут употребляться, дабы рекомендовать больным, принимающим решения здравоохранения.
«Отечественная стратегия занимающихся расследованиями сотрудничеств опухоли зародышевой линии снабжает хороший метод расположить по приоритетам ответственные мутации, на которых мы должны сосредоточиться», сообщила она. «Для получения информации, которая в конечном итоге будет употребляться в клинике, мы должны будем выполнить данный тип анализа еще большего числа больных».